崇祯皇帝看到奏折上内阁票拟后，心中已经有了几分不快。按自己的意思，如此重要的事情，应当急速派人赶赴东江，拿下毛文龙，然后再慢慢调查。不过看在成基命刚刚上任的份上，捏着鼻子按照内阁票拟批红了。
没过几天，辽东袁督师的奏报又过来了。东江毛文龙通奴，疑似已经完全投靠，甚至发现东江数名大将带领建奴攻击锦州、右屯等地。
京师距离辽东、东江均有上千里，难以判断真假；何况东江和辽东本来就不和，两地攻讦之事经常发生；光听一面之辞，肯定不能做出判断。于是，稳重为主的成基命便在奏折上面批复，着兵部派员赴东江核实毛文龙投敌之事，着户部派员前往东江掌控盐税，奏请皇上派遣太监去东江监军。
半夜还在批奏折的崇祯皇帝看到此票拟，终于忍不住了。不顾时间已经深夜，宫门已经下锁，命令内宦把成基命传进了宫来。
崇祯皇帝一开始还能控制自己的情绪，后面却越说越激动：“老先生，前几日地方官弹劾毛文龙。老先生批复，让毛文龙各自上表自辩。如此重要之事，竟然只是自辩？朕给了先生的面子，勉强同意了。如今，袁崇焕又上奏折弹劾毛文龙通奴，并亲见毛文龙属下大将领兵攻打锦州、右屯。东江都已经兵戎相见，辽东诸地已经是势如累卵了。你竟然没有面呈？竟然回家享受去了？再看看内阁的票拟，竟然是派人员前往东江调查？毛文龙反叛都已经是十之**的事情了，竟然还敢派人去东江调查？还有人敢去东江调查么？何况当初毛文龙请旨煮盐的时候，内阁干什么去了？是谁票拟同意的？”
崇祯皇帝连珠炮似的问话，弄得成基命回答的机会都没有。只得跪在地上，等崇祯皇帝说完后，成基命才开口回答道:quot;启禀皇上，地方官弹劾毛文龙通敌，导致辽东民乱之事。老臣以为，此事虽然重要，却不紧急。事情已经发生了，早一日处理，晚一日处理，并不影响大局。袁崇焕、毛文龙均为领兵大臣，国之柱石，不可因地方微末小员一封奏折而作处置。故老臣票拟，让毛文龙自辩。倘若毛文龙自辩令皇上不满意，皇上再派人前往调查也不为晚。 至于袁崇焕弹劾毛文龙之事，此事同样重要而不紧急。即使是最坏的情况，辽东城坚墙厚，可以据城而守，数月之间不至于有大变。 何况辽东远在千里之外，其情形内阁并不清楚，此事又是袁崇焕一面之词。俗话说，偏听则暗，兼听则明。唯有派人前往调查之后，方能做出处置。老臣有一句老话以劝皇上，治大国如烹小鲜！切忌操之过急！”
崇祯皇帝闻听此言，龙颜大怒，开口骂道：“你说朕操之过急，朕却说你是暮气！阁臣尚且如此拖沓，可知地方官员是何等模样了！国事沦落到如今的地步，全因为官员尸位素餐，办事拖沓。你们看看袁爱卿，当初平台召对时，便敢放出豪言，五年平辽。这话何等的豪气。倘若臣子人人如此，朕又何须这样辛苦呢！来人，传朕旨意，着锦衣卫赶赴东江，捉拿毛文龙，押解京师。倘若反抗，格杀勿论！”
成基命磕头回禀道：“皇上，万万不可啊！倘若毛文龙没有反意，皇上派人捉拿，只会冷了前线抗敌士卒之心。万一毛文龙真有反意，正在徘徊踌躇之时，皇上派人缉拿，也只会逼反了毛文龙。”
崇祯皇帝脸色铁青，开口道：“东江煮海为盐，据说旬日之间富可敌国，你到底收了东江多少好处，如此拼命的维护毛文龙？”
听到崇祯皇帝如此绝情的话，成基命心如死灰，磕头回答道：“老臣自万历三十五年入仕，尸位素餐也有二十余年了。老臣如今已经七十有余，老迈年高，不堪再用。还请皇上开恩，放老臣回乡以终天年。至于毛文龙之事，请皇上看在大明江山社稷的份上，不要仓促决定。皇上信不过老臣，老臣也无话可说。还请皇上垂询其余阁臣，万万不可操之过急。”